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上海交通大学a+学科为生物学、机械工程、船舶与海洋工程、临床医学、工商管理。学校有18个学科入选国家“双一流”建设学科；17个学科入选上海市高峰高原学科。
在第四轮学科评估中，全校25个学科入选A类。全校现有一级学科博士学位授权点49个，覆盖经济学、法学、文学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学、教育学等10个学科门类；一级学科硕士学位授权点58个，覆盖12个学科门类。
学校有博士专业学位类别8个；硕士专业学位类别32个；38个博士后流动站；有各类科技创新基地184个，其中国家级33个、省部级136个、国际合作15个，包括：2个国家重大科技基础设施，1个李政道研究所，7个国家重点实验室，1个国家前沿科学中心，1个国家集成攻关大平台，3个国家协同创新中心，1个上海应用数据中心，7个国家工程研究中心，2个国家级研发中心。
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