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健康管理师的考试科目为《理论知识》和《操作技能》。健康管理师采取闭卷机考的形式，考试分为理论知识和操作技能两门科目。两门科目分为两场考试，两门科目必须要一次考过，单科目合格成绩不予保留。
理论知识考试主要考核从业人员从事本职业应掌握的基本要求和相关知识要求；《基础知识》共有十六章节内容，涵盖临床医学、预防医学、常见慢性病、流行病学以及营养与食品安全等相关知识。该科目考察内容相对简单。
技能考核主要考核从业人员从事本职业应具备的技能水平；《操作技能》（三级）共四章节内容，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导和健康危险因素干预。该科目考察考生的实际应用能力，需要考生在理解的基础上进行练习，做到举一反三，能够将知识运用到实际案例中。
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