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安徽医科大学不是中央部委直属高校，安徽医科大学是省部共建大学，安徽省属重点大学。学校前身是1926年5月创办的上海东南医学院。1949年底，响应中共中央华东局“面向农村，走向内地”的号召，东南医学院内迁安徽省，成为安徽省第一所高等医科院校。1952年改名为安徽医学院。1985年更名安徽医科大学。
发展：
2014年，入选安徽省第一批地方特色高水平大学。
2017年1月，经省编办批准，安徽省转化医学研究院正式落户学校，这是全省首个转化医学科学领域实体性研究机构。
2019年7月，国家卫生健康委员会下达首批委省共建重点实验室立项建设任务，由安徽医科大学第一附属医院生殖医学团队牵头的配子及生殖道异常研究实验室获批，系全省首个国家卫生健康委重点实验室。12月，发起成立长三角医学教育联盟。
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