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疫苗保存是一项很重要的工作，各类疫苗均有相应贮存温度和保存条件，若疫苗保存不当，常常会导致疫苗效能降低，甚至失效。弱毒冻干苗一般应低温保存，湿苗则应低温冻结保存，灭活苗应保存于2～8℃，温度过高会引起油佐剂苗的油、水分层，甚至发霉变质，导致抗原性丧失，油佐剂灭活苗、组织灭活苗，铝佐剂苗均不能冻结，否则会破乳，产生凝集块，影响疫苗接种效果。
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