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学校设有18个学院，9个书院，47个系，60个本科专业，43个研究所（中心），并建有良乡校区、研究生院、继续教育学院、现代远程教育学院，高等职业技术学院（房山分校）、北京理工大学西山实验区、秦皇岛分校以及珠海学院。
学院设置为：宇航学院、机电学院、机械与车辆学院、光电学院、信息与电子学院、自动化学院、计算机学院、材料学院、化学与化工学院、生命学院、数学与统计学院、物理学院、管理与经济学院、人文与社会科学学院、马克思主义学院、法学院、外国语学院、设计与艺术学院。
学校现设有19个专业学院、9个书院以及前沿交叉科学研究院、先进结构技术研究院、医工融合研究院等教学科研单位，工程、材料科学、化学、物理、计算机科学、社会科学、环境科学与生态学先后进入ESI国际学科排名前100，其中工程、材料科学两个学科进入前10。
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