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教科室跟教务处不是同一个概念。教务处是教学管理机构，主管各教师的教课任务、目标、进度及学期计划，学生的学习要求、目标、计划及考试等教与学各方面的事务，是学校的重要机构。教科室是中小学的职能部门，负责学校教育科学研究管理工作的中层机构，根据学校教育、教学工作及其改革实践的要求，制定实施学校教育科学研究课题规划。
教科室的管理内容：做好学校教育科学研究课题的申报、论证、审批及其成果的鉴定、评奖、推广和应用等工作。做好学校教育科学研究课题经费的核实、报批和发放等工作。抓好学校教育科学研究的试验工作，完成学校所承担的国家、省、市、县的教育科学研究课题任务。抓好学校教育科学研究的普及和指导工作，定期组织教育科学研究的理论学习、学术报告、信息交流等活动，培训学校教育科学研究骨干。
教务处职责：学科与专业建设、教学计划制订实施。
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