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制药工程专业的就业前景不错，毕业生一般在制药厂、医院等单位从事药剂师、药局行政、制药技术师等工作。有前途的一般认为是做与医学有关的工作，比如研发人员：在制药厂、大学、研究所研究部，从事药物研发;生产工匠：在制药厂，从事药品生产、技术工作;管理工作：在制药厂，从事药品生产技术管理等工作等等。
制药工程专业推荐院校有上海中医药大学、北京中医药大学、中国药科大学、成都中医药大学、广州中医药大学、哈尔滨商业大学、武汉大学、吉林农业大学、长春中医药大学、河南中医学院、湖北中医学院、河南大学、陕西中医学院、江西赣南医学院、南阳理工学院、广东药学院、陕西国际商贸学院、山西中医学院、华中科技大学等。
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