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两个的整体实力相差不多，应该是一个档次。不过如果是上海或者周边地区，两者是一样的，如果到了别的地区，比如北京，复旦可能稍好一些。复旦医学院是原来的上海第一医科大学，国家四所重点之一，卫生部直属，在各地区都有着极高的声望，上海交大是原来的上海第二医科大学，市属院校，在很多地方名头还是差一些的。比如说北京某些医院，如中日友好，明确表示只要原卫生部直属的院校毕业生，这就是有点儿差距了。但是总体来说，这点儿差距是可以无视的。
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