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生物工程硕士毕业后可适宜于医药、食品、环保、商检等部门中生物产品的技术开发、工程设计、生产管理及产品性能检测分析等工作及教学部门的研究与教学工作，研究基因工程、遗传工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程和发酵工程的理论及其在工、医、农、环境保护等部门中的开发和应用、研究改变遗传因子组合、生产出有强抗病性的小麦、利用微生物的作用发酵香蕉、制作甜酒等工作。
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